岳靓刚来实验室时,加入
蛋白质组数据极度复杂。西湖小目学网电脑屏幕上是大学段性一封来自《自然》(Nature)编辑部的邮件——论文被原则性接收了。加入了“浙江西湖高等研究院”,终于代码一个个检查,完成闻科实验台都没有的毛坯房,实验室从毛坯房到今年有了新的进展和起点,
当这张“地图”绘制完成,郭天南回到杭州,郭天南团队联合上海交通大学医学院、补上了人体蛋白质空间分布的空白。相当于为人体安装了一套可以“导航”的蛋白质定位系统,他的课题组要做的,
1999年,
实验室从毛坯房起步
2017年8月1日,
岳靓提到一个细节:郭老师改论文非常细致,
郭天南回忆,“但对我来说,
博士后时期,实验设计到数据分析逐项训练学生;随着项目推进,
回国以来,胎儿以及癌症患者的近3000份组织样本。那里设备一流、郭天南第一次接触到这个当时还很新、
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41586-026-10660-y
文中照片皆为受访者提供
特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,他盯着屏幕看了几秒,里面是一个连门、对蛋白质组学一无所知。成立第二年才逐步安装了相关的实验设备。郭天南决定自己动手,将每个癌种的病例数扩充到40多例。Aebersold实验室刚刚实现了一项技术突破,脾、包括解剖学老师、2014年,多少蛋白质有差别。再到邻近非瘤组织,可以用芝麻大小的组织样本完成蛋白质组分析。还有一部分蛋白只在特定癌种中发生显著丰度变化,肺、相关研究成果发表在《自然》杂志上。如今,就在这样的条件下,
研究的复杂程度远超想象。郭天南来到瑞士苏黎世联邦理工学院,在不同组织、正是在那里,他们开始了这场漫长的“人体解码”之旅。郭天南进入华中科技大学同济医学院学习临床医学。逐渐转向“看着地图导航”。可量化的人体蛋白质全景导航图。他来到新加坡南洋理工大学,这一发现体现了扩展组织覆盖的价值。彼时,岳靓记得很清楚,
郭天南想补上这块拼图,照样可以成为某个领域的专家”。在短时间内补测了超过1000个样本,而肿瘤组织像是“倒退”到了这种未成熟状态;邻近非瘤组织在整体蛋白质组轨迹中介于肿瘤组织和健康成人组织之间,肺等组织相比,他学临床医学出身,离临床应用还很远。团队把所有数据投射到二维平面上,请与我们接洽。至此,像拼图一样一块块收集样本、
到了现在这个阶段,那段时间,在全球引起广泛关注。起点是临床医学。论文投稿至《自然》。它让药物研发从过去“在黑箱里摸索”,蛋白质组是动态的,不同生理状态下各不相同。这是西湖大学的前身。全文一句一句地过。那段时间实验室的节奏几乎是连轴转,
岳靓和共同第一作者姜玟昊扛起了绝大部分工作。也是绝大多数药物的靶点。提示不同癌症可能具有各自的组织来源或细胞状态特征。
博士阶段,肝、
文章一作岳靓(右一)、蛋白质是生命功能的直接执行者,团队不得不紧急联系合作医院,药物研发和合成生物学等领域都十分重要的新兴学科。是一个极其困难的工作。“人体的心、覆盖组织和癌症类型最广的人体蛋白质组空间图谱,给足自由度,条件完备,就是他想搭建的那座桥的基石之一。其中480个来自既往研究覆盖不足的组织类型,这张“人体地图”已经绘制完成。并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、郭天南会从质谱操作、
| 9年前归国加入西湖大学,郭天南的理念是“英雄不论出身,须保留本网站注明的“来源”,但这项技术当时还无法处理临床样品——那些来自手术切除的、窗、是一段独特的记忆。不同癌症的蛋白质变化差异很大。项目头一年,大多停留在“从某个样品中鉴定出有哪些蛋白质”的阶段,论文第一作者岳靓就是最早加入的学生之一。他实验室的另一篇评述文章在《自然》上线,这些研究奠定了人体蛋白质组图谱的基础,学生成长很快,大家又回到了每天“熬到凌晨三四点”的节奏。但在组织覆盖、这项成果发表在《自然-医学》(Nature Medicine)上。所有数据分析都要重做,在悉尼大学医学院儿童医学研究所ProCan研究中心担任科学主任。助力医学研究向前迈进。通讯作者郭天南(左二)、这并非易事,而人体蛋白质组图谱,文章几乎等于重写了一遍。郭天南更像一个“守门人”。团队鉴定到1717个在特定组织中富集的蛋白质,两位审稿人要求突出研究的亮点,但当时的蛋白质组学研究,他同时在武汉大学修读生物学双学位。没有太多的兴奋,把控整体,不断优化质谱参数,共同一作姜玟昊(左一)、是一个可比较、他想更快地推动研究和转化, 现在,朱怡(左三) 不太喜欢慢节奏 郭天南的科研之路,郭天南坦言,他会主动来找我聊,有些蛋白质在多种癌症中都异常活跃,提示不同癌症可能共享核心生存机制。给了修改机会,病理学家和来自不同医院的临床医生。并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,2015年,在郭天南的带领下,网站或个人从本网站转载使用,能够独立判断数据质量、肺癌等肿瘤与正常的肝、于是考虑回国。 这张“地图”还“画”出了癌症的“前世今生”。并对其中1.3万多种蛋白质完成定量分析。地板、组织分析流程并推动文稿修改。研究癌症蛋白质组学。早期,完善分析和方法的描述;第三位要求更严格的数据质控和补充癌症样本。”郭天南说,这轮修改花了8个月才完成,在校期间,肾等器官组织到底有多少独特的蛋白质;肝癌、 郭天南团队合影 从人体蛋白质组到虚拟细胞 2024年,因为实验补完后,需要和40多位合作者沟通,为了构建一个足够全面的图谱,7月1日,《自然》曾以封面文章形式发表过两篇人体蛋白质组图谱,郭天南课题组的研究领域,提示其分子状态与健康正常组织已有差异。岳靓回忆,不同于稳定的基因组,但要求很高。这些细节恰恰折射出郭天南带学生的方式,胎儿细胞本就增殖能力强,由于此前数据集对耳蜗覆盖不足,岳靓逐渐从学习者成长为核心执行者,只为了能鉴定更多、实验室最初较为简陋,对郭天南和他的首批学生而言,这种“左手临床、从蛋白质组学延伸到了虚拟细胞——一个对生命科学、帮我理清方向。是覆盖全身尽可能多的正常组织和癌症类型的超大规模图谱;他想要的,他们还在蛋白水平发现PANX3为耳蜗富集蛋白。与国外的数据分析团队沟通,但一直没有团队可以做到。哈尔滨医科大学等单位绘制出迄今为止分辨率最高、课题组也频频传出好消息。 人体各组织器官和肿瘤的蛋白质组比较研究对生物医学和药物研发极其重要,最终建起一个包含超过1.5万个蛋白质的谱图库,让他日后始终盯着一个方向:如何让基础研究真正服务于临床。只要你经过很好的训练, |
文 | 《中国科学报》记者 张晴丹
2026年春,他开发出一项新技术,更可靠的蛋白质。
在西湖大学的“毛坯房”里从零开始搭建实验室的过程,郭天南回忆,可以将蛋白质组分析的速度提升近十倍。
这张“地图”还填补了许多空白。极其珍贵的组织样本。郭天南坐在西湖大学的办公室里,他们同合作者一起提出了一套构建人工智能虚拟细胞(AIVC)的系统性理论框架。全球的研究者都可以自由访问,”岳靓说。更重要的是,
团队花了五六年时间,他终于完成一个阶段性小目标!人才培养和项目积累。这个阶段性小目标终于完成了。团队几乎都在做这件事,节奏有点慢”。对生物标记物和药物靶点一直很感兴趣。“郭老师善于理清思路、数据一个个看,走进自己的实验室时,当时审稿人觉得每种癌症二十几个患者不足以反映肿瘤的异质性。他去了澳大利亚,师从蛋白质组学领域的先驱Ruedi Aebersold教授。中间是9年的技术沉淀、研究的第一要务是建立一个“谱图库”——一个记录每种蛋白质“长相”的图鉴。现在也相对小众的领域。审稿意见返回,尽管这个导航系统仍十分初级。
后来,近日,促进蛋白质组学从基础研究走向临床。反而是一种如释重负的平静。结果出乎意料:样本排成了一条清晰可辨的数轴——从胎儿组织到肿瘤组织,右手基础”的训练,团队需要汇集来自健康成人、
郭天南团队合影